J'utilise FFMultiConverter, génial, graphique, plein d'options, certaines qu'on peut rajouter en simple déclaration soi-même (pcm s16le), enregistrer l’option comme défaut pour traitements successifs.
La mienne pour DaVinci Resolve 16 en entrée d'un clip H264 AAC:
-vcodec mpeg4 -acodec pcm_s16le -r 25 -b:v 90000k -ac 2 -b:a 192k -ar 44100
et après montage, éventuellement:
-vcodec libx264 -acodec ac3